Bir düşünce kuruluşu olarak SDE’nin temel misyonu ve vizyonu; gelişmiş, bütünleşmiş ve güçlenmiş Türk-İslâm Dünyası’nın oluşumuna; huzur, barış ve güvenlik içinde bir dünya inşasına; Türkiye’nin tarihsel coğrafyasından destek alarak küresel anlamda bir güç olmasına katkı sağlamaktır. Dolayısıyla SDE; bağımsız, demokratik, refah içinde kalkınmış, insan hak ve hürriyetlerine saygılı, manevi ve moral değerlerine bağlı, mutlu, hür ve güçlü bir Türkiye’yi (önce bölgesel bir güç, merkez ülke, sonra küresel bir aktör olmak yolunda) hedef alan, tamamen milli ve bağımsız bir düşünce merkezi olma kararlılığındadır. Bu kapsamda yapılanan SDE;
- Milli ve bağımsız bir strateji merkezine duyulan ihtiyacın sonucudur.
- Ortadoğu ve Avrasya bölgesinde yaşanan küresel güç mücadelesinde, Yeni Ankara’nın kurulan yeni dünyada etkin bir şekilde yer almak arzusunun somut bir göstergesidir.
- Avrasya ve Ortadoğu bölgelerinde çalışan düşünce merkezleri ile ortak aklı oluşturma hedefinin dışa vurumudur.
- Türkiye’nin iktisadi, siyasi ve stratejik anlamda daha güçlü olabilmesini esas alan bir düşüncenin ürünüdür.
- Türk dış politikasında proaktif bir açılım süreci ve bu kapsamda vizyon belirlenmesine katkı sağlayacak bir düşünce merkezi arayışının karşılığıdır.